Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAPQ7Z569 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms