Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMC6Q7Z403 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC6Q7Z403 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms