Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM15Q7Z3B0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM15Q7Z3B0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM15Q7Z3B0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms