Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX6Q7RTT6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX6Q7RTT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX6Q7RTT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms