Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms