Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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