Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWJ1

STXBP4, Syntaxin-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP4Q6ZWJ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STXBP4Q6ZWJ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STXBP4Q6ZWJ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms