Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CFAP47Q6ZTR5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP47Q6ZTR5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP47Q6ZTR5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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