Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TBC1D9Q6ZT07 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TBC1D9Q6ZT07 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms