Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRCAPQ6ZRS2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRCAPQ6ZRS2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms