Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFXL1Q6ZNB6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFXL1Q6ZNB6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFXL1Q6ZNB6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms