Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM72Q6ZMU5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms