Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms