Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms