Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms