Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP26C1Q6V0L0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP26C1Q6V0L0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP26C1Q6V0L0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP26C1Q6V0L0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP26C1Q6V0L0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP26C1Q6V0L0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP26C1Q6V0L0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms