Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO4Q6UY18 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO4Q6UY18 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms