Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC5Q6UXY8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC5Q6UXY8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMC5Q6UXY8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms