Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms