Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms