Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC174Q6PII3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC174Q6PII3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms