Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSANTD2Q6P1R3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD2Q6P1R3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD2Q6P1R3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms