Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAVIN1Q6NZI2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN1Q6NZI2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms