Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC70Q6NSX1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms