Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 EPRS-206ENST00000609181 2968 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.162e-6■■■□□ 16
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NIPBLQ6KC79 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.352e-6■■■□□ 15.8
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NIPBLQ6KC79 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-8■■■□□ 15.7
NIPBLQ6KC79 RPS25-203ENST00000527791 711 ntTSL 210.57□□□□□ -0.722e-8■■■□□ 15.7
NIPBLQ6KC79 RPS25-206ENST00000532567 508 ntTSL 25.51□□□□□ -1.532e-8■■■□□ 15.7
NIPBLQ6KC79 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)19.52■□□□□ 0.723e-11■■■□□ 15.7
NIPBLQ6KC79 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-11■■■□□ 15.7
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NIPBLQ6KC79 RBM12B-204ENST00000519109 615 ntTSL 27.07□□□□□ -1.284e-10■■■□□ 15.7
NIPBLQ6KC79 SMPD4P1-203ENST00000443839 2108 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.238e-6■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 39.78□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.141e-6■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.73e-6■■■□□ 15.6
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