Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms