Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCTP1Q6DN14 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MCTP1Q6DN14 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms