Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms