Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL3Q6DD88 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL3Q6DD88 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms