Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6AWC8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6AWC8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6AWC8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6AWC8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6AWC8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6AWC8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6AWC8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6AWC8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6AWC8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6AWC8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6AWC8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6AWC8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms