Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM29Q5VYK3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms