Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms