Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TAF3Q5VWG9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms