Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GKAP1Q5VSY0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms