Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms