Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC18Q5T9S5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms