Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms