Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC122Q5T0U0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms