Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP55Q53EZ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms