Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP29Q52LW3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP29Q52LW3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms