Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf46Q504U0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms