Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO43Q4G163 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms