Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms