Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP41Q3LFD5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP41Q3LFD5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms