Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms