Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC57Q2TAC2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC57Q2TAC2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC57Q2TAC2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms