Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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