Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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