Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
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