Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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